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Software di analisi delle immagini ad alto contenuto dotato di funzionalità di analisi in time-lapse

 

Il software di acquisizione e analisi delle immagini ad alto contenuto MetaXpress® è una soluzione completa per l’analisi ad alto contenuto che offre un flusso di lavoro integrato rigorosamente orchestrato. La gamma di moduli applicativi supporta una varietà di esigenze, dalla facilità d’uso alla progettazione brevettata di saggi. Il software include strumenti potenti ed eleganti per l’imaging 2D e 3D come l’analisi in time-lapse. Grazie alla nostra procedura guidata di impostazione dell’acquisizione, è possibile generare dati in pochi minuti.

  • Icona Espandibile

    Acquisizione e analisi in 2D e 3D

    Il software MetaXpress è una piattaforma per l’acquisizione e l’analisi di immagini 2D e 3D. Il modulo di analisi delle immagini 3D permette di analizzare sferoidi, microtessuti, cellule in una matrice 3D e piccoli organismi.

  • Icona Semplificazione

    Semplificazione dell’analisi delle immagini

    La casella degli strumenti modulare consente di impostare rapidamente centinaia di saggi ad alto contenuto di uso frequente. Scoprite le nostre selezioni opzionali di moduli applicativi pronti per l’uso per una maggiore praticità.

  • Icona Analisi

    Facile progettazione di analisi personalizzate

    L’editor di moduli personalizzati permette di creare rapidamente procedure composte da varie fasi. Consente di eseguire analisi avanzate come l’identificazione di oggetti all’interno di oggetti e la creazione di classificatori morfometrici per l’analisi delle forme.

Presentazione del kit di strumenti di analisi 3D MetaXpress

Presentazione del kit di strumenti di analisi 3D MetaXpress

Funzioni

  • Icona Misurazione

    Analisi volumetrica 3D e su piani multipli (z-stack)

    I moduli applicativi integrati di acquisizione e analisi per modelli cellulari 3D semplificano la quantificazione ad alto rendimento delle strutture 3D con misurazioni di volume, intensità e distanza.

  • Icona Flusso di lavoro

    Rapidità di acquisizione e analisi

    La nostra tecnologia brevettata ad alta frequenza di fotogrammi permette di acquisire 50 fotogrammi al secondo, facilitando la registrazione di funzioni biologiche rapide. È possibile eseguire l’analisi a 1 colore di una piastra a 384 pozzetti in soli sei minuti.

  • Icona Scelte

    Segmentazione intelligente

    I moduli applicativi sono dotati di funzionalità di segmentazione delle immagini pronti per l’uso per immagini con marcatura in fluorescenza o senza marcatura. L’editor di moduli personalizzati offre strumenti avanzati per migliorare la segmentazione.

  • Icona Scalabile

    Elaborazione in parallelo scalabile

    Il software MetaXpress PowerCore™ esegue analisi di routine in pochi minuti. Questo modulo opzionale sfrutta le potenzialità dell’elaborazione in parallelo per accelerare l’analisi.

  • Icona Digitalizzazione

    Soluzione per la gestione dei dati

    Il gestore dati MDCStore™, incluso nel software MetaXpress, organizza le immagini, le informazioni sperimentali e l’analisi dei dati. Permette di manipolare senza problemi complessi insiemi di immagini e metadati.

  • Icona Analisi

    Informatica avanzata

    Il software di informatica ad alto contenuto AcuityXpress™ è una piattaforma opzionale di livello aziendale che offre funzioni avanzate di estrazione dati, analisi, statistica e visualizzazione. Condivide il database MDCStore per un’integrazione ottimale.

 Soluzioni pronte per l’uso per la maggior parte delle comuni procedure di analisi

 

Moduli applicativi MetaXpress

Velocizzate l’analisi delle immagini e l’elaborazione dei dati utilizzando il nostro software MetaXpress con moduli applicativi che consentono di analizzare i dati in maniera facile e rapida:

  • Micronuclei
  • Crescita neuritica
  • Formazione di tubi nell’angiogenesi
  • Indice mitotico
  • E molte altre applicazioni...

Visualizza moduli

Moduli applicativi MetaXpress

 

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Moduli applicativi del software MetaXpress

Impostate centinaia di saggi HCS di uso frequente indipendentemente dal vostro livello di esperienza. I moduli applicativi del software MetaXpress forniscono un ambiente interattivo per quantificare le misurazioni 2D e 3D, comprese dimensioni, intensità e distanza.

 

  • Modulo di analisi delle immagini 3D

    Modulo di analisi delle immagini 3D

    I saggi complessi e i modelli cellulari tridimensionali rappresentano meglio la biologia dei tessuti e le interazioni cellulari, una caratteristica che li rende più appropriati per numerosi saggi di tossicità e di screening di farmaci. La capacità di utilizzare modelli 3D in un formato ad alto contenuto e alto rendimento è un vantaggio significativo per gli scienziati. Il modulo di analisi delle immagini 3D per il software MetaXpress® è progettato per analizzare sferoidi, microtessuti, cellule in una matrice 3D e piccoli organismi che vengono acquisiti come un serie di piani z.

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    Formazione di tubi nell’angiogenesi

    Modulo applicativo per la formazione di tubi nell’angiogenesi

    Il modulo applicativo per la formazione di tubi nell’angiogenesi facilita l’analisi della formazione di tubi, un sistema modello sperimentale per l’angiogenesi. La promozione o l’inibizione della formazione di vasi sanguigni è una delle principali aree di ricerca nel campo dei tumori, del diabete e di altre malattie vascolari.

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  • Ciclo cellulare

    Modulo applicativo per il ciclo cellulare

    Il modulo applicativo per il ciclo cellulare permette di classificare e quantificare le cellule in varie fasi del ciclo cellulare per studiare la progressione del ciclo cellulare. Nelle cellule sane non tumorali, eventi che provocano danni al DNA, ipossia, alterazioni metaboliche o la distruzione del fuso determinano l’attivazione di checkpoint e l’arresto del ciclo cellulare. Le cellule tumorali generalmente perdono questi checkpoint e si dividono in maniera incontrollata, anche in condizioni difficili. Con gli strumenti appropriati, i ricercatori possono eseguire screening di farmaci che causano l’arresto del ciclo cellulare o la morte cellulare nelle cellule tumorali.

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    Salute cellulare

    Modulo applicativo per la salute cellulare

    Il modulo applicativo per la salute cellulare permette di classificare le cellule in base al loro stato come vitali, in apoptosi precoce, in apoptosi tardiva o in necrosi.

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  • Proliferazione cellulare, versione ad alto rendimento

    Moduli applicativi ad alto rendimento per la proliferazione cellulare

    Il modulo applicativo HT per la proliferazione cellulare è una versione ad alto rendimento di quello per il conteggio dei nuclei (circa 1 minuto per piastra a 96 pozzetti con analisi di un sito per pozzetto senza il software MetaXpress® PowerCore™) con un algoritmo di rilevazione semplificato che fornisce soltanto dati riepilogativi a livello di sito (non di singola cellula) e non salva gli overlay di segmentazione nel database MDCStore.

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    Classificazione delle cellule

    Modulo applicativo per la classificazione delle cellule

    Il modulo applicativo per la classificazione delle cellule è una soluzione generale e flessibile per identificare sottopopolazioni di cellule marcate con una seconda sonda fluorescente ed è ideale per esaminare l’efficienza di trasfezione, l’attivazione di vie di segnalazione (chinasi) o l’adipogenesi.

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  • Conteggio dei nuclei

    Modulo applicativo per il conteggio dei nuclei

    I moduli applicativi per il conteggio dei nuclei permettono di automatizzare il conteggio accurato dei nuclei per la maggior parte dei tipi di cellule e sono ideali per lo studio della proliferazione cellulare, la conta cellulare e la migrazione cellulare. Questo modulo conta i nuclei anche quando lo sfondo non è uniforme, offrendo una segmentazione superiore rispetto alla semplice impostazione di una soglia.

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    Editor di moduli personalizzati

    Editor di moduli personalizzati

    L’editor di moduli personalizzati incluso nella versione 5 del software MetaXpress® è un ambiente flessibile e interattivo in cui gli utenti possono creare e testare un modello per l’analisi delle immagini. Sono disponibili gallerie di opzioni di elaborazione, filtri morfologici, moduli applicativi e metodi di segmentazione per permettere agli utenti di costruire una sequenza di passaggi di analisi. Il nuovo strumento “clicca e trova” permette di identificare facilmente gli oggetti e compila automaticamente i parametri delle schede dei passaggi. Una volta creati, i moduli personalizzati possono essere facilmente condivisi e riutilizzati per analizzare altri set di immagini.

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  • Granularità e Transfluor

    Moduli applicativi per la granularità e la tecnologia Transfluor e per la tecnologia Transfluor in versione HT

    Il modulo applicativo per la granularità e la tecnologia Transfluor facilita l’analisi delle strutture puntiformi come quelle osservate durante il raggruppamento delle molecole target per l’internalizzazione dei recettori oppure all’interno del nucleo o anche dei pattern puntiformi dei mitocondri o di altri organelli.

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    Live/Dead

    Modulo applicativo Live/Dead

    Il modulo applicativo Live Dead è compatibile con i kit dei saggi Live/Dead disponibili in commercio progettati per studiare la proliferazione o la morte cellulare. Esistono applicazioni comuni per il monitoraggio della proliferazione cellulare associata ai tumori o della morte cellulare dovuta a malattie neuromuscolari come il morbo di Alzheimer e il morbo di Parkinson oppure in risposta a eventi citotossici e apoptotici.

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  • Micronuclei

    Modulo applicativo per i micronuclei

    Il modulo applicativo per i micronuclei permette di classificare le cellule in base alla morfologia nucleare per applicazioni di genotossicità, ma è anche una soluzione ideale per lo studio della salute cellulare o di popolazioni cellulari multinucleate con marcatori aggiuntivi per l’analisi dell’apoptosi, della necrosi o per distinguere qualsiasi piccola struttura situata in prossimità di una più grande, come ad esempio una gemma di lievito.

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    Indice mitotico

    Modulo applicativo per l’indice mitotico

    Il modulo applicativo per l’indice mitotico è progettato per la discriminazione quantitativa delle cellule mitotiche e in interfase, uno strumento cruciale per i programmi di scoperta farmacologica in campo oncologico, che fornisce informazioni sui potenziali composti terapeutici antitumorali il cui meccanismo d’azione si basa sull’arresto della mitosi nelle cellule tumorali per impedire una proliferazione incontrollata.

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  • Rilevazione di fusi monopolari

    Modulo applicativo per la rilevazione di fusi monopolari

    Il modulo applicativo per la rilevazione di fusi monopolari permette di monitorare la perturbazione della formazione di fusi bipolari, un meccanismo utilizzato con successo da farmaci come il monastrolo per arrestare la progressione delle cellule tumorali durante la mitosi. Questo modulo permette di quantificare le cellule mitotiche che contengono fusi monopolari o bipolari dopo colorazione con una sonda per il DNA e una sonda per i microtubuli.

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    Classificazione delle cellule a varie lunghezze d’onda

    Modulo applicativo per la classificazione delle cellule a varie lunghezze d’onda

    Il modulo applicativo per la classificazione delle cellule a varie lunghezze d’onda migliora le funzionalità del modulo applicativo per la classificazione delle cellule includendo ulteriori lunghezze d’onda per classificare le popolazioni di cellule in base a numerose marcature.

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  • Traslocazione a varie lunghezze d’onda

    Modulo applicativo per la traslocazione a varie lunghezze d’onda

    Il modulo applicativo per la traslocazione a varie lunghezze d’onda permette di analizzare simultaneamente la traslocazione di fino a 6 sonde (o delle stesse sonde con varie impostazioni), in aggiunta alla colorazione nucleare.

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    Crescita neuritica

    Modulo applicativo per la traslocazione a varie lunghezze d’onda

    Il modulo applicativo per la crescita neuritica è progettato per misurare e caratterizzare la crescita neuritica, l’estensione di processi dal corpo cellulare, che sono parti naturali dello sviluppo neuronale. L’inibizione o la stimolazione della crescita neuritica è coinvolta in un’ampia gamma di disturbi o danni neurologici, compresi ictus, morbo di Parkinson, morbo di Alzheimer e lesioni al midollo spinale.

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  • Traslocazione nucleare, versione ad alto rendimento

    Modulo applicativo ad alto rendimento per la traslocazione nucleare

    Il modulo applicativo HT per la traslocazione nucleare è destinato alla rapida analisi della traslocazione da e verso il compartimento nucleare (circa 1 minuto per piastra a 96 pozzetti con analisi di un sito per pozzetto senza il software MetaXpress® PowerCore™) con un algoritmo di rilevazione semplificato che fornisce soltanto dati riepilogativi a livello di sito (non di singola cellula) e non salva gli overlay di segmentazione nel database MDCStore.

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    Transfluor, versione ad alto rendimento

    Modulo applicativo ad alto rendimento per la tecnologia Transfluor

    Il modulo applicativo HT per la tecnologia Transfluor è una versione ad alto rendimento di quello per la granularità e serve per lo screening rapido (circa 1 minuto per piastra a 96 pozzetti con analisi di un sito per pozzetto senza il software MetaXpress PowerCore) con un algoritmo di rilevazione semplificato che fornisce soltanto dati riepilogativi a livello di sito (non di singola cellula) e non salva gli overlay di segmentazione nel database MDCStore.

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  • Traslocazione e traslocazione in versione ottimizzata

    Moduli applicativi per la traslocazione e per la traslocazione in versione ottimizzata

    I moduli applicativi per la traslocazione e per la traslocazione in versione ottimizzata permettono di quantificare la correlazione tra sonde e compartimenti. Il modulo per la traslocazione è ideale per lo studio del movimento generale dei componenti cellulari dal citoplasma al nucleo con un numero minimo di regolazioni. Il modulo per la traslocazione in versione ottimizzata offre invece maggiori funzionalità con una definizione più fine delle regioni per la traslocazione e la possibilità di studiare la traslocazione in compartimenti non nucleari come i mitocondri.

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Risorse del software di acquisizione e analisi delle immagini ad alto contenuto MetaXpress

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Presentazioni
Video e webinar
Rilevazione della complessità della biologia 3D

Rilevazione della complessità della biologia 3D: uso di organoidi per la modellazione delle malattie e le ricerche sulla tossicità

Imaging e analisi di un modello 3D delle vie respiratorie basato su organoidi

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Immunologia e flusso di lavoro relativo allo sviluppo di vaccini

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Flusso di lavoro per gli ibridomi

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Annotazione delle piastre ed estrapolazione delle curve nel software MetaXpress

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Acquisizione delle piastre sul sistema ImageXpress Micro Confocal utilizzando il software MetaXpress

Guida rapida: Acquisizione delle piastre sul sistema ImageXpress Micro Confocal utilizzando il software MetaXpress

Revisione delle immagini sul sistema ImageXpress Micro Confocal utilizzando il software MetaXpress

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Analisi delle immagini sul sistema ImageXpress Micro Confocal utilizzando il software MetaXpress

Flusso di lavoro di base dall’acquisizione all’analisi delle immagini sul sistema ImageXpress Micro Confocal utilizzando il software MetaXpress

Screening ad alto contenuto per l’identificazione di miRNA

Screening ad alto contenuto per l’identificazione di miRNA

Identificazione di inibitori selettivi della via di segnalazione di STAT3

Identificazione di inibitori selettivi della via di segnalazione di STAT3

Oliver Kepp e Jayne Hesley - Rilevazione di firme di morte cellulare mediante imaging ad alto contenuto

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Sistema multidimensionale ImageXpress Micro Confocal

Imaging ad alto rendimento multidimensionale con il nuovo sistema ImageXpress Micro Confocal

Ridefinizione dei limiti dello screening ad alto contenuto

Ridefinizione dei limiti dello screening ad alto contenuto

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Saggi multiplex di citotossicità ad alto contenuto utilizzando epatociti derivati da iPSC

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Analisi mediante imaging ad alto contenuto della morfogenesi di strati di cellule utilizzando modelli tissutali 𝘪𝘯 𝘷𝘪𝘵𝘳𝘰

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Imaging ad alto contenuto semplice e flessibile per la quantificazione di eventi biologici complessi

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Strumenti contemporanei di automazione e imaging ad alto contenuto per lo screening di cardiomiociti derivati da cellule staminali

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Uso dello screening ad alto rendimento dell’RNA per identificare i fattori dell’ospite che influiscono sulle infezioni virali

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Applicazione di strumenti di HCA per la scoperta farmacologica nel campo degli anticorpi

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Impostazione di saggi su sferoidi 3D mediante imaging ad alto contenuto

Applicazioni con cellule staminali pluripotenti nella scoperta farmacologica

Applicazioni emergenti con cellule staminali pluripotenti indotte nella scoperta farmacologica

  • Citation
    Dated: Dec 07, 2012
    Publication Name: PLOS ONE

    Analyzing Illumina Gene Expression Microarray Data from Different Tissues: Methodological Aspects of Data Analysis in the MetaXpress Consortium

    Microarray profiling of gene expression is widely applied in molecular biology and functional genomics. Experimental and technical variations make meta-analysis of different studies challenging. In a total of 3358 samples, all from German population-based cohorts, we investigated the effect of data preprocessing and the variability due to sample… View more

    Microarray profiling of gene expression is widely applied in molecular biology and functional genomics. Experimental and technical variations make meta-analysis of different studies challenging. In a total of 3358 samples, all from German population-based cohorts, we investigated the effect of data preprocessing and the variability due to sample processing in whole blood cell and blood monocyte gene expression data, measured on the Illumina HumanHT-12 v3 BeadChip array

    Contributors: Claudia Schurmann, Katharina Heim, Arne Schillert, Stefan Blankenberg, Maren Carstensen, Marcus Dörr, Karlhans Endlich, Stephan B. Felix, Christian Gieger, Harald Grallert, Christian Herder, Wolfgang Hoffmann, Georg Homuth, Andreas Ziegler  
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  • Citation
    Dated: Oct 25, 2011
    Publication Name: Springer Nature

    Immunohistochemical characterisation of cells co-producing insulin and glucagon in the developing human pancreas

    In adult human islets, insulin and glucagon production is largely restricted to individual cell populations. The production of these hormones is less segregated during development and during the differentiation of human pluripotent stem cells towards pancreatic lineages. We therefore sought to characterise the transcription factor profile of these… View more

    In adult human islets, insulin and glucagon production is largely restricted to individual cell populations. The production of these hormones is less segregated during development and during the differentiation of human pluripotent stem cells towards pancreatic lineages. We therefore sought to characterise the transcription factor profile of these cells that co-produce insulin and glucagon in the developing human pancreas, and thus to gain insight into their potential fate during normal pancreas development.

    Contributors: M. J. Riedel, A. Asadi, R. Wang, Z. Ao, G. L. Warnock & T. J. Kieffer  
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  • Citation
    Dated: Feb 15, 2008
    Publication Name: Journal of Neuroscience Methods

    NeuriteTracer: A novel ImageJ plugin for automated quantification of neurite outgrowth

    In vitro assays to measure neuronal growth are a fundamental tool used by many neurobiologists studying neuronal development and regeneration. The quantification of these assays requires accurate measurements of neurite length and neuronal cell numbers in neuronal cultures. Generally, these measurements are obtained through labor-intensive manual… View more

    In vitro assays to measure neuronal growth are a fundamental tool used by many neurobiologists studying neuronal development and regeneration. The quantification of these assays requires accurate measurements of neurite length and neuronal cell numbers in neuronal cultures. Generally, these measurements are obtained through labor-intensive manual or semi-manual tracing of images. To automate these measurements, we have written NeuriteTracer, a neurite tracing plugin for the freely available image-processing program ImageJ. The plugin analyzes fluorescence microscopy images of neurites and nuclei of dissociated cultured neurons. Given user-defined thresholds, the plugin counts neuronal nuclei, and traces and measures neurite length. We find that NeuriteTracer accurately measures neurite outgrowth from cerebellar, DRG and hippocampal neurons. Values obtained by NeuriteTracer correlate strongly with those obtained by semi-manual tracing with NeuronJ and by using a sophisticated analysis package, MetaXpress. We reveal the utility of NeuriteTracer by demonstrating its ability to detect the neurite outgrowth promoting capacity of the rho kinase inhibitor Y-27632. Our plugin is an attractive alternative to existing tracing tools because it is fully automated and ready for use within a freely accessible imaging program.

    Contributors: Madeline Pool, Joachim Thiemann, AmitBar-Or, Alyson E.Fournier  
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