Una piattaforma intuitiva e potente per la profilazione fenotipica

 

Il software StratoMineR™ di Core Life Analytics aiuta i biologi ad analizzare i dati complessi ottenuti dall’analisi delle immagini ad alto contenuto. Un flusso di lavoro potente e intuitivo consente agli utenti di trasferire i dati analizzati nel software di analisi delle immagini IN Carta® direttamente in StratoMineR, dove vengono adoperati per produrre ricche visualizzazioni interattive utilizzando avanzati metodi di data mining.

  • Realizzato per i biologi

    Realizzato per i biologi

    Intuitivo flusso di lavoro analitico. Nessuna codifica necessaria.

  • Analisi fenotipica

    Analisi fenotipica

    Utilizzate tutti i vostri dati ad alto contenuto per scoprire nuovi fenotipi.

  • Intelligenza artificiale

    Intelligenza artificiale

    Costruite i vostri propri modelli di IA per scoprire i farmaci del futuro

Introduzione ad HC StratoMineR

Introduzione ad HC StratoMineR

Funzioni

  • Caricamento flessibile dei dati

    Caricamento flessibile dei dati

    I dati numerici possono essere caricati direttamente dal software di analisi delle immagini IN Carta.

  • Intelligenza artificiale

    Intelligenza artificiale

    È possibile applicare modelli di apprendimento automatico per sfruttare la tecnologia basata sull’IA nell’analisi dei dati.

  • Caratterizzazione fenotipica

    Caratterizzazione fenotipica

    Raggruppamento e visualizzazione dei fenotipi cellulari.

  • Controllo di qualità

    Controllo di qualità

    Utilizzate gli strumenti integrati di visualizzazione dei dati per una rapida valutazione della loro qualità e per rimuovere i valori erratici.

  • Ridotta complessità dei dati

    Ridotta complessità dei dati

    La riduzione dei dati diminuisce la complessità e permette di concentrarsi sulle interazioni biologiche chiave.

  •  Collaborazione

    Collaborazione

    Utilizzate gli strumenti di gestione dei progetti per favorire la collaborazione.

Importate dataset dal software IN Carta per una comprensione più approfondita dei vostri dati

Il software di analisi delle immagini IN Carta permette di ottenere solidi risultati quantitativi dai dataset e dalle immagini biologiche complesse utilizzando un’avanzata tecnologia basata sull’IA. Importate direttamente questi dati in StratoMineR, un’intuitiva piattaforma basata sul web che guida gli utenti attraverso un flusso di lavoro tipico nell’analisi dei dati multiparametrici ad alto contenuto.

Flusso di lavoro intuitivo di StratoMineR

 

Analisi dei cluster

Analisi dei cluster con StratoMineR

Analisi dei cluster: A) È mostrato un dendrogramma che rappresenta i rapporti gerarchici. B) Sono mostrati esempi di cellule che sono state trattate con composti, appartenenti ad alcuni dei cluster. Il cluster 5 è costituito dalle cellule trattate con tetrandrina e clorochina. Il cluster 4 è costituito dalle cellule trattate con rotenone e paclitaxel.

Diagramma di dispersione

Diagramma di dispersione

Esempio di un diagramma di dispersione generato utilizzando HC StratoMineR per la visualizzazione e l’analisi.

Sistema di imaging ad alto contenuto ImageXpress® Confocal HT.ai

Potenti sorgenti luminose multi-laser, un modulo a disco confocale con penetrazione tissutale profonda, obiettivi a immersione in acqua e un moderno software di analisi ad apprendimento automatico

Nuovo tagImagexpress confocal
  • Ideale per saggi 3D e basati su cellule a elevata complessità
  • Laser ad alta intensità a sette canali che produce immagini più luminose con un rapporto segnale/rumore più alto
  • Tecnologia a disco confocale rotante per una penetrazione più profonda nel tessuto, che permette di ottenere immagini più nitide con una maggiore risoluzione
  • Obiettivi a immersione in acqua che permettono di quadruplicare il segnale a tempi di esposizione più brevi per una maggiore sensibilità e nitidezza delle immagini
  • Visualizza il prodotto

Software di analisi delle immagini IN Carta

Moderno software di analisi delle immagini ad alto contenuto ad apprendimento automatico

Software CellReporterXpress per ImageXpress Pico

Le potenti funzionalità analitiche combinate con un’intuitiva interfaccia utente semplificano i flussi di lavoro per l’analisi delle immagini e la profilazione fenotipica. Le funzioni avanzate forniscono le capacità necessarie per analizzare i dati in 2D, 3D e 4D su larga scala e ottenere informazioni in tempo reale senza la necessità di complesse operazioni pre- o post-elaborazione. Migliorate la specificità dei vostri flussi di lavoro per l’analisi delle immagini utilizzando il modulo di deep learning SINAP e verificate di persona che la segmentazione non è un problema. Grazie alla tecnologia di apprendimento automatico, è possibile eseguire complesse analisi fenotipiche con l’intuitivo modulo Phenoglyphs.

Ultime risorse

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Applicazioni di StratoMineR

  • Cell Painting

    Cell Painting

    Il Cell Painting è un saggio multiplex ad alto contenuto basato su immagini, utilizzato per la profilazione citologica. In un saggio di Cell Painting vengono utilizzati fino a sei coloranti fluorescenti per marcare diversi componenti della cellula, tra cui il nucleo, il reticolo endoplasmatico, i mitocondri, il citoscheletro, l’apparato di Golgi e l’RNA. L’obiettivo è quello di “colorare” la cellula quanto più possibile per acquisirne un’immagine rappresentativa nella sua interezza.

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    Imaging e analisi cellulare

    Imaging e analisi cellulare

    I ricercatori hanno a disposizioni varie opzioni per quanto riguarda i metodi di imaging cellulare, dalla microscopia a contrasto di fase che mostra le cellule intatte all’imaging a fluorescenza di singole molecole od organelli. L’analisi cellulare viene eseguita per valutare e misurare lo stato corrente delle cellule, come l’integrità cellulare, la tossicità, la vitalità e varie altre applicazioni di ricerca. Una parte integrante dell’analisi cellulare è la raccolta, analisi ed esportazione dei dati in un formato utile e significativo.

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  • Ricerca sulle cellule staminali

    Ricerca sulle cellule staminali

    Le cellule staminali pluripotenti possono essere utilizzate per studi nel campo della biologia dello sviluppo oppure differenziate per ottenere cellule di organi specifici e impiegate per saggi basati su cellule vive o fissate su vetrini o in piastre multipozzetto. Il sistema ImageXpress è utile in tutte le fasi del flusso di lavoro adoperato dai ricercatori nel campo delle cellule staminali, dal monitoraggio del differenziamento al controllo di qualità alla misurazione delle funzionalità di specifici tipi cellulari.

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    Tossicologia

    Tossicologia

    La tossicologia è lo studio degli effetti avversi dei composti chimici naturali e artificiali su un organismo vivente. Nel mondo moderno è un problema sempre più sentito, dato che siamo esposti a un numero sempre maggiore di composti chimici sia nell’ambiente in cui viviamo che nei prodotti che usiamo.

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Risorse di StratoMineR

Presentazioni
Video e webinar
Serie di seminari sull’imaging 3D

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Screening fenotipico ad alto contenuto

Screening fenotipico ad alto contenuto

Modelli emergenti di organoidi

Modelli emergenti di organoidi: dalla ricerca di base allo sviluppo di farmaci e alla medicina rigenerativa